《本草纲目》共收录了中药一千八百三十二种，共五十二卷。
在药物解说方面，本草纲目包括八个部分：
释名，罗列典籍中药物的异名，并解说诸名的由来；
集解，集录诸家对该药产地、形态、栽培、采集等的论述；
修治，介绍该药的炮制法和保存法；
气味，介绍该药的药性；
主治，列举该药所能治的主要病症；
发明，阐明药理或记录前人和自己的心得体会；
正误，纠正过去本草书中的错误；
附方，介绍以药为主的各种验方及其主治。
本草纲目·草部（上） 本草纲目·草部（中） 本草纲目·草部（下） 本草纲目·金石部 本草纲目·木部 本草纲目·水部 本草纲目·火部 本草纲目·土部 本草纲目·谷部 本草纲目·果部 本草纲目·鳞部 本草纲目·兽部 本草纲目·禽部 本草纲目·虫部 本草纲目·介部 本草纲目·菜部 本草纲目·人部